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Forme SARS-CoV-2ICTV Le SARS-CoV-2 (acronyme anglais de severe acute respiratory syndrome coronavirus 2), soit coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu s\u00E9v\u00E8re, est le virus responsable du Covid-19. Son acronyme est parfois partiellement francis\u00E9 en SRAS-CoV-2.Ce coronavirus hautement pathog\u00E8ne a \u00E9t\u00E9 d\u00E9couvert en d\u00E9cembre 2019 dans la ville de Wuhan (province de Hubei, en Chine). Le SARS-CoV-2 est un virus \u00E0 ARN monocat\u00E9naire de polarit\u00E9 positive du groupe IV de la classification Baltimore. Il appartient au genre betacoronavirus qui regroupe entre autres les SARS-CoV-1 et MERS-CoV. Le SARS-CoV-2 est une nouvelle souche de coronavirus SARSr-CoV. Dans un contexte de faible immunit\u00E9 collective, le SARS-CoV-2 circule presque toute l'ann\u00E9e. Avec le temps, il est possible que le SARS-CoV-2 circule sur un mode \u00E9pid\u00E9mique plus saisonnier, entre janvier et mai dans les zones \u00E0 climat temp\u00E9r\u00E9, tout comme le HCoV-NL63, le HCoV-229E et le HCoV-OC43, des coronavirus responsables de simples rhumes. Le SARS-CoV-2 est principalement transmis par les microgouttelettes et a\u00E9rosols et a un tropisme particulier pour le syst\u00E8me respiratoire sup\u00E9rieur (nez, trach\u00E9e) et inf\u00E9rieur (bronches, poumons). Un site compl\u00E9mentaire de r\u00E9plication primaire est le syst\u00E8me digestif, en particulier l\u2019estomac et les intestins. Le SARS-CoV-2 peut se diss\u00E9miner dans l\u2019organisme via les neurones. Lorsque le SARS-CoV-2 atteint le syst\u00E8me nerveux central, il peut se produire une perte totale ou partielle d\u2019odorat (anosmie). Le SARS-CoV-2 a de nombreux sites secondaires de r\u00E9plication : le syst\u00E8me cardiovasculaire, le syst\u00E8me immunitaire, le syst\u00E8me endocrinien, le syst\u00E8me urinaire, le syst\u00E8me reproducteur et les glandes sudoripares de la peau. Le principal r\u00E9cepteur cellulaire utilis\u00E9 par le SARS-CoV-2 pour infecter des cellules est l\u2019enzyme ACE2. Ce r\u00E9cepteur est reconnu par la prot\u00E9ine S du SARS-CoV-2 qui op\u00E8re l'essentiel du processus d\u2019entr\u00E9e du virus dans une cellule. Le SARS-CoV-2 poss\u00E8de au total environ 29 prot\u00E9ines virales. Certaines d\u2019entre elles sont sp\u00E9cialis\u00E9es dans le d\u00E9tournement de la machinerie de la cellule infect\u00E9e. D\u2019autres participent activement \u00E0 la r\u00E9plication du g\u00E9nome viral. Le SARS-CoV-2 peut infecter des cellules par fusion directe ou en \u00E9tant absorb\u00E9 par une cellule via un processus d\u2019endocytose. Le SARS-CoV-2 a aussi la facult\u00E9 de fusionner des cellules infect\u00E9es avec les cellules non infect\u00E9es avoisinantes, formant des \u00AB syncytia \u00BB, c\u2019est-\u00E0-dire des cellules g\u00E9antes englobant des dizaines de cellules productrices de virus. Pr\u00E9sentant une vitesse actuelle de mutation de l\u2019ordre de 5,2\u2009\u00E0 8,1 \u00D7\u202F10\u22123 substitutions par site et par an, le SARS-CoV-2 est l'un des virus qui mutent le plus vite au monde. La r\u00E9ponse immunitaire face au SARS-CoV-2 diff\u00E8re d'un patient \u00E0 l'autre : 40 % sont asymptomatiques, 40 % d\u00E9veloppent un Covid l\u00E9ger, 15 % une forme mod\u00E9r\u00E9e pouvant conduire \u00E0 un Covid long, et 5 % un Covid s\u00E9v\u00E8re pouvant n\u00E9cessiter des soins de r\u00E9animation. La r\u00E9ponse immunitaire inn\u00E9e et adaptative des formes s\u00E9v\u00E8res de Covid-19 est globalement contre-productive et g\u00E9n\u00E8re autant de d\u00E9g\u00E2ts dans l'organisme que le virus. L'origine du SARS-CoV-2 n'est pas r\u00E9solue. Le r\u00E9servoir animal des sarbecovirus se trouve chez les chauve-souris asiatiques du genre Rhinolophus (les rhinolophes). Son adaptation \u00E0 l'humain pourrait r\u00E9sulter d\u2019un passage direct des chauves-souris aux humains, mais il est \u00E9galement possible qu'elle se soit faite par une transmission impliquant un h\u00F4te interm\u00E9diaire encore ind\u00E9termin\u00E9, ou soit le fruit d'un gain de fonction en laboratoire."@fr .
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